Kod Adı Kırlangıç'ta Hayalet'in gerçek kimliğinin ortaya çıkmasıyla okulda büyük bir hesaplaşma başlıyor. Öğrenciler ve öğretmenler, Şirket ajanlarına karşı nefes kesen bir mücadeleye girerken, Yiğit Efe ve Hayalet'in antik kapı önündeki yüzleşmesi tüm dengeleri değiştirecek.