Klamidya mikrobu, tedavi edilmediğinde özellikle kadınlarda üreme organlarına büyük zarar verebilen enfeksiyon kaynağıdır. Özellikle rahim iç dokusu hasarı (endometrit) ve tüplerin hasarı (salpenjit) sonrasında kısırlığa kadar giden durumlara yol açabilir.
Enfeksiyonlar genelde gizli seyreder. Belirtileri hafif seyirli olduğundan teşhisi de zordur. Bunlar :

İdrar yapma esnasında ağrı ve yanma hissi
Sık idrara çıkma
Genital bölgede ağrı ve ödem
Ateş
Cinsel organdan su veya süt benzeri akıntı
Adet dışı kanama veya akıntı
Soğuk algınlığıyla birlikte seyreden karın ağrısı